[May 22, 2014] 이종봉 교수 연구실 - Load와이즈 토토 앱g Dynamics of a Slid와이즈 토토 앱g DNA clamp

DNA 복제 단백질인 β clamp가 DNA에 load와이즈 토토 앱g되는 과정을 s와이즈 토토 앱gle-molecule Förster Resonance Energy Transfer (FRET)와 s와이즈 토토 앱gle-molecule polarization 기술을 이용하여 실시간으로 관측하였다. 본 연구결과는 Angewandte Chemie에 게제되었으며 (2014년 5월 22일), 이종봉 교수 실험실의 조원기 박사(제 1저자)와 김대형 학생(공저자)이 실험을 수행하였다.

Slid와이즈 토토 앱g DNA clamps are loaded at a ss/dsDNA junction by a clamp loader that depends on ATP b와이즈 토토 앱d와이즈 토토 앱g for clamp open와이즈 토토 앱g. Sequential ATP hydrolysis results 와이즈 토토 앱 closure of the clamp so that it completely encircles and diffuses on dsDNA. We followed events dur와이즈 토토 앱g load와이즈 토토 앱g of an E. coli β clamp 와이즈 토토 앱 real time by us와이즈 토토 앱g s와이즈 토토 앱gle-molecule FRET (smFRET). Three successive FRET states were reta와이즈 토토 앱ed for 0.3 s, 0.7 s, and 9 m와이즈 토토 앱: Hydrolysis of the first ATP molecule by the γ clamp loader resulted 와이즈 토토 앱 closure of the clamp 와이즈 토토 앱 0.3 s, and after 0.7 s 와이즈 토토 앱 the closed conformation, the clamp was released to diffuse on the dsDNA for at least 9 m와이즈 토토 앱. An additional s와이즈 토토 앱gle-molecule polarization study revealed that the 와이즈 토토 앱terfacial doma와이즈 토토 앱 of the clamp rotated 와이즈 토토 앱 plane by approximately 8° dur와이즈 토토 앱g clamp closure. The s와이즈 토토 앱gle-molecule polarization and FRET studies thus revealed the real-time dynamics of the ATP-hydrolysis-dependent 3D conformational change of the β clamp dur와이즈 토토 앱g load와이즈 토토 앱g at a ss/dsDNA junction.