토토 커뮤니티 순위PHYSICS/ BK21 Colloquium[09
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Toward an Unified Description for Thermodynamics,
Folding Kinetics, and Mutagenesis of Proteins”
* Speaker : Prof. Ik Soo Chang[Pusan National University]
* Place : 토토 사이트 커뮤니티 Seminar Room (Science Bldg, 3-201)
* Date & Time : Oct,토토 사이트 커뮤니티16Fri)토토 사이트 커뮤니티4:00 ~ 5:00 pm
Abstract
A multiscale-heterogeneous protein energy function was developed for the biophysical study of the
thermodynamics, folding kinetics, and mutagenesis of proteins. After hybridizing an토토 사이트 커뮤니티atomic토토 사이트 커뮤니티force-
field into a coarse-grained energy function to account for the specificity of a토토 사이트 커뮤니티sequence토토 사이트 커뮤니티of토토 사이트 커뮤니티amino
acids even with the high structural homology, we constructed an exact free energy landscape of a
given protein and characterized its thermodynamics and folding-unfolding kinetics via토토 사이트 커뮤니티a토토 사이트 커뮤니티Chevron
plot based on solving exactly a master equation, which would enable us to pursue토토 사이트 커뮤니티a토토 사이트 커뮤니티mutagenesis
application. Our approach was applied successfully for resolving a controversy토토 사이트 커뮤니티about토토 사이트 커뮤니티the토토 사이트 커뮤니티folding
mechanism of fast folding proteins.
Recent experiments claiming that BBL protein follows a global downhill folding raised an important
controversy as to the folding mechanism of fast folding proteins. Under the global downhill folding
scenario not only proteins undergo a gradual folding, but also folding events along the continuous
folding pathway could be mapped out from the equilibrium denaturation experiment. Based on the
exact calculation using a free energy landscape, relaxation eigenmodes from토토 사이트 커뮤니티a토토 사이트 커뮤니티master토토 사이트 커뮤니티equation,
and Monte Carlo simulation of an토토 사이트 커뮤니티extended토토 사이트 커뮤니티Munoz-Eaton토토 사이트 커뮤니티model토토 사이트 커뮤니티that토토 사이트 커뮤니티incorporates토토 사이트 커뮤니티multiscale-
heterogeneous pairwise-interactions between amino acids, here we show that the very nature of a
two-state cooperative transition such as a bimodal distribution from an exact free energy landscape
and biphasic relaxation kinetics do manifest in the thermodynamics토토 사이트 커뮤니티and토토 사이트 커뮤니티folding-unfolding토토 사이트 커뮤니티kinetics
of BBL and peripheral subunit-binding domain (PSBD) homologue. Our results provide an unequivocal
resolution to the fundamental controversy related to토토 사이트 커뮤니티the토토 사이트 커뮤니티global토토 사이트 커뮤니티downhill토토 사이트 커뮤니티folding토토 사이트 커뮤니티scheme,토토 사이트 커뮤니티whose
applicability to other proteins should be critically re-examined.
Contact Person : Prof. Ki Bong Lee (054-279-2068, kibong@postech.ac.kr)
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Abstract
A multiscale-heterogeneous protein energy function was developed for the biophysical study of the
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Contact Person : Prof. Ki Bong Lee (054-279-2068, kibong@postech.ac.kr)
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